С появлением Государственных стандартов ВПО первого поколения (в середине 90-х годов) преподаватели кафедры обеспечивают преподавание психолого-педагогических дисциплин на всех факультетах РУДН. В 1999 году в РУДН были открыты специальность и направление «Психология» и кафедра педагогики и психологии становится
выпускающей. В 1999 г. был произведен первый набор на направление «Психология» (дневное отделение), в 2000 г. – на специальность «Психология» (вечернее отделение).
В 2004 году в результате внедрения новых учебных и научно-исследовательских программ
кафедра педагогики и психологии меняет название и становится
кафедрой социальной и дифференциальной психологии с курсом общей психологии и педагогики (зав. кафедрой – действительный член МАН ВШ, академик МАНПО, д.психол.н., профессор, заслуженный работник Высшей школы РФ А.И. Крупнов) . В этом же году состоялся первый выпуск бакалавров и специалистов (второе высшее образование) по направлению «Психология», а первый выпуск магистров-психологов состоялся в 2006 году.
В это время преподаватели кафедры обеспечивают как подготовку бакалавров, специалистов и магистров по направления и специальности «Психология», так и продолжают обеспечивать преподавание психолого-педагогических дисциплин на всех факультетах РУДН. Преподавателями кафедры были опубликованы учебно-методические пособия и курсы лекций для студентов большинства факультетов РУДН.
В 2004 в связи с открытием в РУДН диссертационного совета по защите диссертаций на соискание ученых степеней по специальностям 19.00.01 (общая психология, психология личности, история психологии) и 13.00.01 (общая педагогика, история педагогики и образования) значительно активизируется работа аспирантуры кафедры, с этого времени выпускники аспирантуры кафедры защищаются в РУДН.
В рамках научной школы системных исследований личности в этот период был выполнен ряд исследований по грантам РГНФ под руководством А.И.Крупнова (целостно-функциональный подход к изучению свойств личности; психологическая структура и природа черт характера; гендерные различия в проявлениях свойств личности; этнопсихологические особенности черт личности; сравнительный анализ личностных и когнитивных характеристик активности в читых и поражённых радиацией зонах; структура организационно-психологических характеристик представителей различных социальных групп и др.). Концепция системно-функциональной природы свойств личности легла в основу целого ряда исследований, проведенных в разных городах России (Москва, Санкт-Петербург, Екатеринбург, Рязань, Брянск, Тольятти, Тамбов и др.) и за рубежом.
В 2008 году кафедра социальной и дифференциальной психологии с курсом «Общей психологии и педагогики» была преобразована в:
- кафедру социальной и дифференциальной психологии (зав. каф. – действительный член МАН ВШ, академик МАНПО, д.психол.н., профессор, заслуженный работник Высшей школы РФ А.И. Крупнов)
- кафедру психологии и педагогики (зав. каф. – Александр Валерьевич Гагарин, доктор педагогических наук, профессор, действительный член Международной академии акмеологических наук).